Mycoclé pour les nuls …
et pour les autres …
Mycoclé
Logiciel de navigation dans les clés dichotomiques
Télécharger et exécuter Mycocle_inst.exe
http://mycolim.free.fr/DOC_SML/mycoCLE/Charg_Mycocle.htm
L’installation est automatique.
NB : Sous Vista ou W7 il est préférable de faire l’installation en
mode Administrateur
Lancement
Une liste de clés est proposée par défaut (la modification du fichier par défaut est possible simplement)
- Propositions -1
- Historique des choix -2
- Historique des sections / Fenêtre traduction -3
- Liste des espèces / Liste des sections -4
- Chargeur des clés en cours -5
- Fenêtre résultat -6
Recherche élémentaire pas à pas
Exemple :
>Double clic sur (1) « Clé simplifiée inspirée de l'ouvrage de Phillips »
>Continuer la recherche en validant par exemple les dernières propositions de la liste
On obtient dans la fenêtre (6): « Hypholoma , Stropharia et proches » et dans (2) l’historique des différentes propositions de la clé qui ont amené ce résultat :
° Champignons à lamelles, pied central et spores brun-pourpre à noir
° Non déliquescent
° Pas très cassants/fragiles
° Lames non tachetées
° Lames pas très décurrentes
° Sans anneau persistant mais parfois des restes de voile sur le pied, lames adnées
° Spores brun-pourpre
En cas de doute, il est possible, à chaque pas, de revenir en arrière en pressant le bouton « <= » puis de choisir une autre proposition.
A chaque validation d’un choix, la liste des espèces (4) satisfaisant aux conditions validées est recalculée et affichée. Il en est de même pour la liste des sections (il n’y en a pas dans cet exemple simple)
>Faire RAZ (= « Remise A Zéro ») pour afficher la liste complète (4) des espèces prévues par la clé en cours
>Dans (4) Cliquer sur « Agrocybe » : dans l’historique (2) s’affiche la liste des choix de la clé qui amènent à cette espèce.
Chargement d’une autre clé
Par défaut les clés sont stockées dans le répertoire Mycocle\donnees (modifiable).
> Faire « fichier/ouvrir »
Clés disponibles
à télécharger sur http://mycolim.free.fr/DOC_SML/mycoCLE/cles_div/
vers le répertoire de votre choix .
Pour déplacer la clé dans le répertoire « \donnees » de Mycomètre on peut simplement
-faire « fichier/ouvrir »
-glisser la clé depuis le répertoire de stockage vers la fenêtre ouverte.
(Nb : avec W7 cette
méthode évite d’avoir à autoriser l’opération)
A partir de l’explorateur, il suffit de cliquer sur le
fichier « xxxx.cle » pour
ouvrir Mycoclé.
plusieurs sessions de Mycoclé peuvent être lancées en même temps (pour comparer
des clés , par ex.)
Fonctions avancées
Options d’affichage
- Dans « paramètres », on peut choisir la taille de la police
- Lorsque les descriptions sont très longues : marquer la proposition, puis clic droit pour ouvrir une fenêtre d’édition plus grande (noter que cette même fenêtre peut être utilisée pour copier le texte de la proposition). Fermeture par clic gauche.
- la fenêtre de Mycoclé s’ouvre en plein écran. On peut la
réduire et la repositionner.
Affichage des
sections
Si la clé le prévoit, le nom des sections, sous-sections
etc.. s’affiche dans la fenêtre (3)
Chargeur de clés
La liste des clés chargées lors d’une session s’affiche dans la fenêtre (5)
Pour rappeler une clé préalablement chargée, il suffit de cliquer sur le nom de la clé
Figures,
documentations et autres fichiers
Si la clé le prévoit, Mycoclé permet l’affichage de croquis, photos, documentation, site web, autre clé (c’est ainsi qu’est conçue la clé Defaut.CLE livrée en exemple) et même de lancer un exécutable : en fait tous les fichiers reconnus par windows.
L’exécution de ces fichiers externes est automatique par défaut. On peut l’interdire en décochant « exec auto » dans le menu « options »
Exemple : dans « corticiés_JCV.cle » ou dans « geopora_Dougoud.cle » différentes planches sont disponibles.
Certains utilisateurs ont conçu, grâce à Mycoclé, de véritables « dossiers » complets, par groupe d’espèces, contenant toutes les clés disponibles sur le groupe, les images, les documentations, les liens Web.
Nb : il n’est
malheureusement pas possible de distribuer ces réalisations pour des raisons de
limitation des droits d’auteurs des diverses documentations incluses.
Rappel d’une session
précédente interrompue
Hypothèse : vous avez bien avancé dans votre recherche, mais n’avez pas terminé.
Quittez votre session par « fichier /quitter »
Lors de nouvelle ouverture de Mycoclé faites « fichier/session précédente »
Mycoclé reprend la recherche là ou vous l’aviez laissée (même clé et même position)
NB : le point de
recherche n’est pas modifié si vous quittez par le « X » de la
fenêtre (en haut à droite)
C'est-à-dire par exemple
Travail sur la clé des entolomes, sortie par « fichier /quitter »
Nouvelle ouverture de Mycoclé
et travail sur les géopora, sortie par X
Ouverture de Mycoclé avec « fichier/session précédente »
La clé des entolomes est reprise à la page des
description où vous l’aviez laissée
Entrée par espèce voisine
Supposons que l’espèce à déterminer semble voisine d’une espèce connue. Il est souvent intéressant d’afficher l’historique de cette espèce, puis remonter dans la clé (bouton <= ) jusqu’à trouver le choix qui distingue la nouvelle espèce.
Exemple : clé des coprins de Uljé
On a trouvé une espèce faisant penser à Coprinus cinereus
Dans la liste (4), Clic sur C. cinereus puis « <= »
On obtient
l’alternative suivante
Veil with one kind of
elements, sausage-shaped in chaines; pileus up to
Veil with two kinds of
elements; pileus up to
Et les
possibilités : C. candidolanatus et C. cinereus
Entrée par section
Exemple : alnicola_pam_2007.cle
Cliquer sur « section » au-dessus de (4) puis clic sur « sect. Amarescens »
On vérifie dans l’historique les propositions qui amènent à sect. Amarescens, puis on continue la recherche dans la clé.
Entrée par mot clé
Exemple : clé des alnicola
>Presser « mot clé »
> entrer dans la première ligne « saveur » er « amère » dans la seconde
> cocher l’option « ET »
Mycoclé propose 4 choix .
Marquer par exemple la dernière proposition puis presser « valider » : Mycoclé propose 3 espèces répondant à ce critère.
Traducteur (nécessite une connection à un serveur internet)
Exemple : coprins de Uljé
> ouvrir la clé
> presser « traduction » : une fenêtre s’ouvre en dessous de l’historique
> choisir « anglais »
« et cocher
« automatique » ( NB : le premier
choix possible est »détection automatique »)
> presser «traduire »
> commencer vos choix dans la fenêtre (1) : toutes les propositions de la fenêtre (1) sont traduites dans la fenêtre inférieure.
> cocher « historique» : la traduction s’applique alors à la fenêtre de l’historique.
NB :
-
la qualité de la traduction dépend beaucoup de la qualité sémantique de la clé
d’origine.
- la première traduction peut sembler un peu lente (selon serveur). Les traductions suivantes sont beaucoup plus rapides
-la langue de l'utilisateur est sauvée dans le fichier .ini (faire "options/sauver les options")
-si la directive de la langue source a été déclarée dans la clé, la langue est automatiquement adaptée au chargement.
Il est très simple d'ajouter la directive de langue dans les clé existantes (avec Notepad).
Syntaxe de la directive (exemple) : REM$LANGUE$Danoiss
Documentation
personnelle
Il est supposé que vous disposez d’une documentation personnelle sur votre machine ou sur un disque USB ( en Pdf, Doc , Xls , images etc …)
Presser le bouton « Doc » pour chercher l’espèce trouvée dans les noms de fichiers de votre documentation personnelle.
Attention : il faut au préalable valider les options « répertoire documentation » et « configurer documentation »
Outils externes (nécessite une connection à un serveur internet)
Google :cherche l’espèce désignée dans la fenêtre (6) parmi les images de Google
Exemple « « Crepidotus Consiglio&Setti.cle » : clic sur C. cesatii puis presser « Google »
MycoDB
Même exemple, presser sur MycoDB (en collaboration avec MycoDB)
INPN :
Même exemple, presser sur INPN (en
collaboration avec MycoDB)
Mycoclé cherche C Cesatii dans l'Inventaire National du Patrimoine Naturel
Myco France :
Presser « Myco France » pour accéder à la recherche
bibliographique de
A noter que le serveur Mycofrance ne permet pas actuellement d’insérer
automatiquement les paramètres, il vous faut donc faire un couper/coller pour
renseigner la case ‘espèce’ avec Cesatii…
Bibliograhie de Jacques
Trimbach disponible
via MycoDB
Création d’une clé
La syntaxe du format CLE a été étudiée pour être facilement utilisée sans aucun logiciel spécifique.
Il suffit d’un éditeur de texte quelconque ( notepad, word ..) pour éditer une clé.
La syntaxe est très simple et est décrite dans l’aide de Mycoclé (quelques
améliorations ont été apportées depuis la publication de cette aide, mais sans
incidence sur le fonctionnement des clés)
On pourra s’inspirer des clés existantes.
Les logiciels Moduloclé et Moduloclé2 (Hervé Deconchat) sont des outils efficaces et performants pour adapter facilement une clé existante.
Le menu Outils
La fonction « mise au point » permet de déceler et situer la plupart des erreurs de conception de la clé.
Elle permet aussi d’appeler l’éditeur et de renuméroter une clé. Voir la documentation de Mycoclé.
Clés codées
Pour satisfaire les exigences de quelques auteurs, certaines clés peuvent être cryptées.
Les clés cryptées ne sont pas utilisables avec la version de démonstration. Ces clés ne peuvent pas être utilisables sans le logiciel Mycoclé (l’affichage ou l’impression du fichier ne permet pas de reconstituer les liens).
Autres options
Les menus principaux proposent diverses options très simples qui ne sont pas décrites ici.
Remarques diverses
- On peut évidemment installer Mycoclé sur un autre disque que le disque par défaut. On pensera alors à redéfinir le répertoire des données par défaut.
- Sous w7 un utilisateur a eu des difficultés pour utiliser le traducteur. Il semble qu'il a résolu le problème en faisant "clic droit puis résoudre les problèmes de compatibilité".